1．协作网委员会，设有主任委员、副主任委员、委员，以上人员从协作网成员单位主要负责人中产生。委员会成员每两年改选一次。

2．协作网委员会下设协作网管理办公室，在协作网委员会领导下负责协作网日常工作的运作管理。办公室设在中华医学电子音像出版社。

3．协作网成员，协作网从成立之日起吸纳三批共43家院校进入协作网。